A bioinformática tem sido definida de muitas maneiras diferentes, mas é comum considerar esta disciplina como a aplicação da matemática, computação e estatística para a análise da informação biológica. Conheça 17 excelentes ferramentas de bioinformática gratuitas e de código aberto para Linux.
Bioinformática
O objetivo da bioinformática é permitir a descoberta de novos insights biológicos e criar uma visão mais ampla e crítica a partir da qual os princípios unificadores da biologia podem ser percebidos. Ela é muito importante no campo da pesquisa do genoma humano.
A bioinformática tornou-se crucial para tecnologias de medição em larga escala, como sequenciamento de DNA, microarrays e metabolômica. Seu campo tem sido auxiliado significativamente por hardware e software baseados em Linux. Existem várias distribuições Linux que oferecem uma estação de trabalho bioinformática integrada. A popular distribuição Bio-Linux contém centenas de programas de bioinformática abrangendo vários campos diferentes.
Há uma ampla seleção de ferramentas de bioinformática Linux lançadas sob uma licença de código aberto. Este artigo identifica excelentes ferramentas são extremamente úteis para qualquer pessoa interessada em análise de sequência, modelagem molecular, dinâmica molecular, análise filogenética e muito mais. Esperamos que este recurso seja útil para biólogos.
Abaixo está um gráfico elaborado pelo Linux Links, com 17 softwares gratuitos e de código aberto.
Vamos explorar as 17 ferramentas de bioinformática disponíveis. Para cada aplicativo, compilamos sua própria página de portal, fornecendo uma captura de tela do software em ação, uma descrição completa com uma análise aprofundada de seus recursos, juntamente com links para recursos relevantes.
Ferramentas de Bioinformática
Bioconductor: Análise e compreensão de dados genômicos de alto rendimento;
Biopython: Ferramentas para computação biológica escritas em Python;
BioPerl: Ferramentas Perl para biologia molecular computacional;
IGV: Ferramenta de navegador de genoma de visualização de alto desempenho;
InterMine: Integrar fontes de dados biológicos;
GROMACS: Pacote versátil para realizar dinâmica molecular;
UGENE: Conjunto de software de bioinformática integrado;
BioJava: Fornece ferramentas Java para processamento de dados biológicos;
Bedtools: Poderoso conjunto de ferramentas para aritmética do genoma;
EMBOSS: A suíte de software aberto de biologia molecular europeia;
Clustal Omega: Programa de alinhamento de múltiplas sequências;
BLAST: Algoritmo para comparar informações de sequência biológica primária;
Taverna Workbench: Para projetar e executar fluxos de trabalho de bioinformática;
Jalview: Edição, visualização e análise de alinhamento de múltiplas sequências;
geWorkbench: Plataforma de software para análise integrada de dados genômicos;
Bandage: Visualizando gráficos de montagem de novo;
Bioclipse: Bancada de trabalho de química e biologia de plataforma de cliente rich;