Bioinformática é uma área que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia. O objetivo da bioinformática é permitir a descoberta de novos insights biológicos e criar uma visão mais ampla e crítica a partir da qual os princípios unificadores da biologia possam ser percebidos. Neste post, você conhecerá 17 excelentes ferramentas de bioinformática Linux gratuitas e de código aberto.
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A bioinformática
A bioinformática é muito importante no campo da pesquisa do genoma humano. Tronando-se crucial para tecnologias de medição em larga escala, como sequenciamento de DNA, microarranjos e metabolômica. O campo da bioinformática tem sido significativamente auxiliado por hardware e software baseados em Linux.
Existem várias distribuições Linux que oferecem uma estação de trabalho de bioinformática integrada. A popular distribuição Bio-Linux empacota centenas de programas de bioinformática abrangendo diversos campos diferentes. Há uma ampla seleção de ferramentas de bioinformática Linux lançadas sob uma licença de código aberto.
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Este artigo identifica excelentes ferramentas que são extremamente úteis para qualquer pessoa interessada em análise de sequências, modelagem molecular, dinâmica molecular, análise filogenética e muito mais. Abaixo, um gráfico elaborado pelo LinuxLinks com 17 excelentes ferramentas de bioinformática Linux gratuitas e de código aberto.
Ferramentas de Bioinformática
- Bioconductor: Uma ferramenta para análise e compreensão de dados genômicos de alto rendimento;
- Biopython: Um conjunto de ferramentas para computação biológica escritas em Python;
- BioPerl: Um conjunto de ferramentas Perl para biologia molecular computacional;
- IGV: Uma ferramenta de navegação de genoma de visualização de alto desempenho;
- InterMine: Com essa ferramenta, você consegue integrar fontes de dados biológicos;
- GROMACS: Pacote versátil para realizar dinâmica molecular;
- UGENE: Conjunto de software integrado de bioinformática;
- BioJava: Uma ferramenta que fornece ferramentas Java para processamento de dados biológicos;
- bedtools: Conjunto de ferramentas poderoso para aritmética do genoma;
- EMBOSS: O conjunto europeu de software aberto de biologia molecular;
- Clustal Omega: Programa de alinhamento de múltiplas sequências;
- BLAST: Algoritmo para comparar informações de sequência biológica primária;
- Taverna Workbench: Para projetar e executar fluxos de trabalho de bioinformática;
- Jalview: Edição, visualização e análise de alinhamento de múltiplas sequências;
- geWorkbench: Plataforma de software para análise integrada de dados genômicos;
- Bandage: Visualizando gráficos de montagem de novo;
- Bioclipse: Bancada de trabalho de química e biologia de plataforma rica em clientes.
Todos os softwares citados acima são gratuitos e de código aberto e, algum deles deve ser útil para sua necessidade. Basta escolher um deles!
